巧克力囊肿看似一种甜蜜的病症，实际上是长在子宫内部的一种肿瘤，因为颜色呈现深褐色和巧克力的颜色一样而命名。出现了巧囊之后，很多女性都怀有侥幸心理，认为它是良性的可以自然恢复，那么真的是这样吗?巧克力囊肿不治疗会怎么样呢?
巧克力囊肿是子宫内膜内异症的一种表现，目前子宫内异症在女方因素而行试管婴儿的患者中约占30%，而子宫内异症患者不孕症的发生率高达40—50%。
巧克力囊肿可损害卵巢内血管分布，降低卵巢对促性腺激素的反应，减低卵巢的储备。
一、卵巢巧克力囊肿的主要治疗方法
1.药物治疗
目前多采用GNRHa治疗。但单纯采用GNRHa会抑制排卵，不主张单用，多用于试管婴儿的前期治疗。国内及国际大多数的研究认为，试管婴儿前应用2至6个月的GNRHa治疗可以增加试管婴儿的优质胚胎率、着床率，降低流产率。
用此种方案的患者，促排卵所需的药量增加，获卵数减少，患者的信心会受到打击，会自认为我条件很差，成功希望渺茫等，但最终的治疗结果显示，此类患者可以得到与单纯输卵管因素患者相似的临床妊娠率和较低的流产率。
2.手术治疗
手术切除盆腹腔表面的内异症病灶，可能会改善盆腔的毒性环境，但会导致卵巢储备不可逆的降低，术后一年妊娠率10%—30%，效率低。对无症状的3cm卵巢巧克力囊肿可以不必手术治疗。对需要手术的患者应该充分评价患者的卵巢储备情况及手术对卵巢可能的损害及患者的耐受情况方可向患者推荐。
3.试管婴儿治疗
试管婴儿治疗已成为巧囊患者获得妊娠的一种主要的方法。国内外研究报道，巧囊患者的试管婴儿成功率略低于单纯输卵管因素的患者，但统计学无差异。子宫内膜异位症患者，特别是中重度患者和经历过手术的患者，可能会获得相对较少的卵子数，但这并不影响她们的妊娠成功率。
二、对于巧克力囊肿的术者
在进入促排的疗程中，会观察子宫和卵巢的情况，巧克力囊肿可能会出现以下两种情况：
1.如果巧克力囊肿面积过大，则建议先通过手术把囊肿切除再做试管，避免囊肿影响卵泡的质量;
2.如果巧克力囊肿面积不影响做试管，那可以先穿刺取卵，再进行手术，或者有些囊肿小面积不影响试管的疗程，就无需做任何的手术;所以，子宫内膜异位症患者，即使卵巢储备很差，也不要因为获卵数少、卵巢储备差而失去信心，只要你们不懈的努力，你们的努力就会获得丰厚的回报，做母亲的愿望将不再是梦想。
三、巧克力囊肿不治疗会怎样
巧克力囊肿不治疗首先会影响到性生活怀孕导致女性不孕。第二就是月经期会有疼痛。第三个相对是最危险的，因为巧克力囊肿虽然属于子宫内膜异位症的一种但是会有异常的增生、浸润转变为恶性肿瘤的一个风险引发卵巢癌高发，所以综合三点，特别是第三点建议及早进行手术治疗，避免引发严重的并发症不良反应。
所以说一但出现了巧囊，虽然不一定要治疗但是一定要去医院检查，确定巧囊的性质，如果是良性的可以一边调理一边观察，如果有转恶性的趋势一定要及时治疗，已避免加剧病情为后续治疗产生影响。
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